Церковь является частью монастырского комплекса, построенного в честь Св. Иоанна Божия. Основные его здания появились в конце XVII века и дошли до наших дней почти в неизменном виде. Расположен монастырь в живописном месте на западе старого Гоа, на горе Монте Санто, что означает «святая».
Комплекс, который возводился очень быстрыми темпами, был построен в благотворительных целях. В 1685 году в Индию прибыли члены общества госпитальеров (братства Святого Иоанна Богослова).
О дальнейшей истории монастыря известно немного и лишь из отдельных свидетельств историков. Например, один из них писал, что в сороковых годах XIX века здесь жили священнослужители и монастырские работники, однако к тому времени данному религиозному учреждению уже десять лет как было запрещено нанимать людей на службу.
Известно также, что в монастыре в 1852-ом году XIX века в ходе ремонта были отреставрированы росписи. В то же время крыша церкви была разобрана и не восстановлена, в результате чего (по свидетельствам 1878 года) здание выглядело покинутым и заброшенным. Архитектура церкви типична для Гоа и отличается, разве что, наличием только одного входа вместо трех.
